L'équipe de NCIS poursuit sa mission pour combattre un groupe de terroristes sans le soutien de Gibbs, en convalescence après l'explosion. Ce dernier doit toutefois surmonter sa perte de mémoire, lorsque son équipe et son patron viennent lui rendre visite. En effet, son aide est capitale, car il est la seule personne à détenir des informations sur les plans des terroristes. Il doit impérativement fouiller dans ses souvenirs avant l'attaque terroriste...