Un ancien agent de la NSA, accusé d'avoir volé des informations top secrètes, est activement recherché par le NCIS pour l'enlèvement de la fille de l'agent spécial Michelle Lee... Parallèlement, l'équipe doit s'appuyer sur des informations provenant d'individus douteux, pour empêcher un criminel de voler des secrets gouvernementaux.