L’informateur qui devait livrer la Grenouille au N.C.I.S pour trafic d’armes, a été exécuté sous ses yeux de la directrice, Jenny Shepard, qui avait pris l’initiative de se rendre seule au rendez-vous. Cette dernière, pourtant impliquée dans la fusillade, exerce une forte pression sur la CIA et le FBI pour faire avancer son enquête. Pendant ce temps, Tony dîne avec Jeanne et sa mère pour la première fois…