L’équipe de Gibbs enquête sur la mort du Colonel Frederik Cooper, tué sur un cour de golf réservé aux militaires. Il pourrait s’agir d’un acte terroriste sur lequel le N.C.I.S doit travailler en coopérant avec l’unité d’investigation criminelle de l’Armée représentée par le lieutenant colonel Mann, qui ne laisse pas Gibbs indifférent… Pour identifier la cellule terroriste, McGee use de ses compétences pour craquer les fichiers protégés des services secrets. Pour venger la mort de son père, le fils de Cooper, destiné à de brillantes études à Princeton, décide de s’engager dans les Marines…