Lors d'une visite de jeunes rangers, Abby fait une démonstration de recherche d'empreinte avec un jeune garçon... Les résultats sont surprenants, car il s'avère que le cobaye de cette expérience est un enfant qui a disparu depuis 1998... L'équipe du N.C.I.S prend l'affaire en main. Les enquêteurs s'occupent tour à tour de l'enfant et doivent collaborer avec deux agents des affaires classées pour retrouver le père du garçon... Ce dernier, en fuite, serait accusé de meurtre.